Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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