Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN8P56748 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN8P56748 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms