Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH11P55287 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH11P55287 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms