Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms