Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV1P50549 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ETV1P50549 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms