Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NMUP48645 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NMUP48645 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms