Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A2P43354 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms