Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTGDSP41222 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms