Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBRP36941 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms