Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF2RBP32927 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms