Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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