Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTFRP26992 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms