Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms