Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP11P24347 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP11P24347 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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