Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FGFR3P22607 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms