Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASTP20810 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASTP20810 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASTP20810 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASTP20810 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASTP20810 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms