Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms