Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms