Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CREB1P16220 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CREB1P16220 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CREB1P16220 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms