Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRAFP15056 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRAFP15056 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRAFP15056 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms