Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT13P13646 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT13P13646 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT13P13646 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT13P13646 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms