Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BMP4P12644 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms