Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLA1P09884 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLA1P09884 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLA1P09884 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLA1P09884 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms