Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD4P09016 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms