Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAPGEF3O95398 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAPGEF3O95398 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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