Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSVO60911 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms