Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN2O60636 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms