Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPLO60437 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPLO60437 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPLO60437 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPLO60437 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPLO60437 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms