Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPAG9O60271 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms