Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF13O43567 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms