Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO3O43524 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms