Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E9PBE3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E9PBE3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
E9PBE3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E9PBE3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms