Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HACD1B0YJ81 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms