Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms