Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNPO3Q9Y5L0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms