Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms