Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SBNO2Q9Y2G9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms