Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IGSF9BQ9UPX0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IGSF9BQ9UPX0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms