Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms