Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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COPS3Q9UNS2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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COPS3Q9UNS2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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COPS3Q9UNS2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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COPS3Q9UNS2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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COPS3Q9UNS2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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COPS3Q9UNS2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS3Q9UNS2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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