Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSR3Q9UNL2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSR3Q9UNL2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms