Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX6Q9UNH7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms