Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms