Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms