Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGXB4Q9UGU5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms