Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DUX4Q9UBX2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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