Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms