Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EHD3Q9NZN3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EHD3Q9NZN3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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