Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA2D2Q9NY47 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms