Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms